Legisladores de distintas bancadas acusaron al diputado, José Horacio Rodríguez, de querer boicotear la aprobación del Código Penal, luego de que éste denunciara que el proyecto de ley contempla una jurisdicción penal militar, para conocer delitos cometidos por los miembros de los cuerpos castrenses.

Luego de acontecimientos y acusaciones de la Operación Coral 5G, en la que acusan a múltiples miembros del cuerpo militar de corrupción, se ha abierto un debate en la aprobación del nuevo Código Penal: La creación de un Tribunal Militar que juzgue las infracciones penales de los agentes.

Esta proposición ha provocado la división de miembros del Senado de la República. Esto porque hay quienes creen que el Tribunal establecería orden y sería un sistema de juicio apropiado para miembros castrenses. Sin embargo, otros loconsideran innecesario debido a que el Código Penal abarca los estatutos que deben seguir militares y civiles.